Если сравнивать процесс производства и процесс управления, то последний существенно уступает по количеству «ступеней». Технологический процесс сегодня требует более плотной связи между отдельными ступенями процесса и более комплексный обмен информацией. Функции, имеющиеся в системах верхнего уровня дискретных производств должны присутствовать уже непосредственно на уровне управления (т.е. среднем уровне). То есть MES-функции должны быть напрямую интегрированы в уровень управления производством.  Только так технологические особенности могут оптимально учитываться в решение глобальных производственных задач и общем процессе производства.

Ведущие Институты поддерживают эту точку зрения на место MES в автоматизации систем управления:

• NAMUR – международное Объединение Пользователей Систем автоматизации и MES на высокотехнологичных производствах– утверждает, что нужно рассматривать MES-функции как неотъемлемую часть любой автоматической системы управления.
• Согласно исследованиям «Gartner Group» системы ERP-Systeme существенно повзрослели вместе с ростом уровня автоматизации систем управления, что в скором времени приведет к вытеснению классических MES-систем.